Nació en Krefeld, Alemania en 1899, de origen judío y con una tradición científica de dos generaciones por parte de su padre. En 1933 debido a la presión del Nazismo debió abandonar Alemania y continuo sus estudios en el Instituto de Genética Animal en Edimburgo, Escocia. Durante 1937 trabaja con H. J. Muller, en la inducción de mutaciones en Drosophila melanogaster. A través de este primer contacto con Drosophila melanogaster inicia el trabajo que es considerado el más importante de su vida. Durante la década de los 40’ diversos agentes químicos eran utilizados en la industria de manera indiscriminada, Auerbach somete a larvas de Drosophila melanogaster a dos de compuestos de uso frecuente: el gas mostaza y el formaldehído. En 1944 publica sus resultados que demuestran de manera contundente, que ambos químicos son capaces de inducir mutaciones en Drosophila melanogaster de la misma manera en que lo hacían los rayos X, estos resultados abrieron una nueva área de investigación: la Toxicología Genética. El trabajo de Auerbach se enfoca a partir de entonces en el análisis específico de la acción de agentes probablemente mutagénicos. Dados sus meritos la Universidad de Edimburgo le proporciona su propio laboratorio de investigación. Publica varios libros en donde resalta el riesgo mutagénico que implican algunos agentes físicos, químicos y biológicos, también escribe diversas metodologías para el análisis de agentes mutagénicos e imparte conferencias sobre el riesgo que implica la mutagénesis y los beneficios de su estudio. En 1967 Es nombrada jefa del área de investigación científica de la Universidad de Edimburgo. Recibió varios reconocimientos y grados honorarios, incluyendo las medallas de la Real Sociedad de Edimburgo y de la Real Sociedad de Londres, así como el premio Darwin al mérito científico, participa en 1969 como co-fundadora de la Environmental Mutagen Society. La Dra. Charlotte Auerbach murió el 17 de marzo de 1994.
